Евгения Ивановна стояла у истоков Института археологии и этнографии. Становление ее как ученого происходило в 1970-е в неповторимой творческой атмосфере новосибирского Академгородка. Находясь в постоянном общении с выдающимися исследователями, представителями различных наук, и талантливой молодежью, она сама сформировалась в блестящего ученого, внесшего весомый вклад в отечественную и мировую археологию, пишет паблик «Новосибирск скорбит».
Основные научные труды Евгении Ивановны связаны с изучением народа мохэ, обитавшего в период раннего средневековья на территории Дальнего Востока. В 1970–1980-е Е.И. Деревянко вела археологические исследования на городищах, поселениях и могильниках мохэ. Археологическим свидетельствам, полученным в результате раскопок поселений и могильников, Е.И. Деревянко придала статус этнографических и исторических источников, которые в сочетании с письменными данными позволили всесторонне реконструировать этнокультурные процессы, протекавшие в огромном регионе в эпоху раннего средневековья.
Активную научную жизнь Евгения Ивановна сочетала с общественной работой. Многие годы она выполняла обязанности заместителя заведующего отделом археологии палеометалла ИАЭТ СО РАН. Евгения Ивановна была настоящей душой коллектива. Через ее зоркий глаз и заботливые руки прошли все диссертации будущих кандидатов и докторов наук.
